1996年
2月4日至9日 自治区第五次党代会召开。10日，中共新疆维吾尔自治区第五届委员会举行第一次会议，王乐泉当选自治区党委书记。
3月9日 中共中央总书记江泽民主持召开中央政治局常委会议，研究部署新疆稳定工作。会议指出，当前影响新疆稳定的主要危险是民族分裂主义和利用宗教进行的各种非法活动。
7月5日至7日 “八五”国家重点科技攻关项目“巴格买里光电示范村”通过鉴定，其成果达到国内先进水平。被称为“戈壁孤岛”的鄯善县巴格买里村，成为我国西北地区最大的、各种充电应用技术最全的综合性太阳能光电示范村。
9月6日 国家“九五”重点建设项目，南疆铁路库尔勒至喀什段开工典礼在库尔勒市举行，中共中央政治局常委、国务院总理李鹏专程率国家有关部委领导出席开工典礼。
9月11日 石河子大学挂牌，中共中央总书记江泽民题写了校名。经过合并组建，石河子大学成为一所兼有农、医、工、经济、理、教育等学科的综合性大学。
10月5日 自治区实施“基本普及九年制义务教育、基本扫除青壮年文盲”现场会在库尔勒市召开。
10月 中组部、人事部发出《关于做好为新疆选派干部工作有关问题的通知》，干部援疆工作启动。
11月8日 中国、巴勒斯坦、吉尔吉斯斯坦、哈萨克斯坦4国过境运输正式开始试运行。
是年 自治区党委提出并实施“一白（棉花）一黑（石油）”为重点的优势资源转换战略。新疆已成为我国纺织业和石油化工业的原料基地。
1997年
2月19日 邓小平同志在北京病逝。自治区党委、人大、人民政府、政协、新疆军区、新疆生产建设兵团向中共中央、国务院并邓小平同志治丧委员会发去唁电，沉痛悼念邓小平同志逝世。
4月1日 乌鲁木齐至奎屯高速公路破土动工并举行奠基仪式。这是新疆第一条高速公路，也是国家规划重点建设的“两纵两横”国道主干线之一，是亚欧大陆桥的重要组成部分，是自治区基础设施建设中的重点工程项目。
4月20日 全国农业科研单位科技兴农暨体制改革工作经验交流会在乌鲁木齐召开。
4月 根据中央决策和自治区党委的部署，为期8个月的集中整治工作在全区全面展开。主要开展集中整治社会治安、严厉打击暴力恐怖犯罪的斗争。
8月21日 红军西路军进疆纪念园在哈密市落成。园内的“红军西路军进疆纪念馆”，展出内容共八个部分，比较完整地展现了西路军艰苦卓绝、浴血奋战的历史画卷。
10月 自治区农村改水防病工作全面完成。从1995年起，全区共投入10亿多元资金，解决了460万牧民的饮水问题，提前完成三年改水任务。
11月28日 自治区举行新闻发布会宣布：伽师抗震救灾和恢复重建工作顺利完成，全部灾民在入冬前迁入新居。
1998年
4月17日 年输送能力达6.3亿立方米的彩南输气管道竣工。这是我国建成的第一条横穿沙漠的长距离、大口径天然气输气管道。
7月5日至9日 江泽民总书记在新疆考察工作。
7月15日 由新疆医学院和新疆中医学院合并而成的新疆医科大学成立。
9月17日 自治区党委、自治区人民政府发出《关于开展向吴登云同志学习的决定》。
10月 我国最长的通信光缆干线——亚欧光缆工程开通。
12月28日 《新疆日报》报道，彩色棉花在新疆库尔勒市和阿瓦提县试种成功。
1999年
4月2日 自治区“三讲”（讲学习、讲政治、讲正气）教育动员大会召开。
5月27日 我国第一台自行设计的行走式采棉机在新联集团诞生，填补了国产采棉机的空白。
9月9日 新疆军区举行“纪念中国人民解放军进军新疆50周年座谈会”。
9月 党的十五届四中全会决定实施西部大开发战略。2000年7月25日，自治区出台《西部大开发——新疆开发规划》。
10月3日 乌鲁瓦提水利枢纽工程水库蓄水达到2500万立方米，惠及下游30多万亩土地。这标志着乌鲁瓦提主体工程基本完工，开始逐年全面发挥效益。
10月6日 中国新疆石油公司西北局在塔里木盆地探明一个5亿吨级特大整装油气田。
10月23日 由江泽民总书记题写馆名的自治区图书馆隆重开馆。这是我国藏有少数民族文字图书资料版本最为丰富的公共图书馆之一。
12月27日 被誉为“西部瓜王”的吴明珠和细毛羊育种专家的刘守仁当选为中国工程院院士。
2000年
1月24日 教育部出台《关于内地有关城市开办新疆高中班的实施意见》。
2月 中央办公厅印发《关于建立维护新疆稳定联席会议制度及组成单位的通知》。
4月24日 自治区召开“西气东输”工作会议。同日，自治区“西气东输”工程建设领导小组成立。
4月 自治区党委作出优先发展天山北坡经济带，带动自治区全面发展的重大战略决策。
10月11日 江泽民总书记在党的十五届五中全会闭幕后，就维护新疆稳定和加强反分裂斗争问题发表重要讲话。
11月5日至8日 自治区党委五届七次全委（扩大）会议讨论通过《自治区国民经济和社会发展第十个五年计划纲要》。
（自治区党委党史和文献研究院提供）
